- 1927 m. lapkričio 15 d. buvo įsteigtas Aklųjų institutas Kaune.
- 1928 m. vasario 27 d. prasidėjo pirmieji mokslo metai Kauno aklųjų institute.
- Nuo 1975 m. Kauno silpnaregių mokykla-internatas,
- Nuo 1998 m. Kauno silpnaregių internatinė mokykla,
- Nuo 2005 m. Kauno aklųjų ir silpnaregių ugdymo centras,
- Nuo 2006 m. Kauno apskrities aklųjų ir silpnaregių ugdymo centras,
- Nuo 2010 m. Kauno Prano Daunio aklųjų ir silpnaregių ugdymo centras,
- Nuo 2015 m. rugsėjo 1 d. prie Centro prijungtas Kauno vaikų abilitacijos centras,
- Nuo 2016 m. rugsėjo 1 d. Kauno Prano Daunio ugdymo centras.
1991 m. birželio 13 d. Kauno miesto Kultūros ir švietimo skyriui priklausantis 61-asis lopšelis –darželis buvo reorganizuotas į įstaigą vaikams su labai žymiais sutrikimais ir suteiktas Vaikų abilitacijos namų pavadinimas. 1995 m. jam suteiktas Kauno vaikų abilitacijos centro pavadinimas.
2005 m. liepos 14 d. Kauno miesto savivaldybės tarybos sprendimu centras reorganizuotas į 4 lavinamąsias ir 2 abilitacines grupes vaikams su autizmo sindromu ir kompleksine negalia. Tais pačiais metais įkurtas autizmo sindromą ir kompleksinių sutrikimų turinčių vaikų konsultacinis centras „Kitoks mano pasaulis“, kuriame teikiamos konsultacijos ir metodinė pagalba Kauno miesto vaikams, tėvams ir specialistams.
Kauno vaikų abilitacijos centras savo metodinę bazę kūrė bendradarbiaudamas su Norvegijos karalystės, Vestfoldo grafystės Solvango centru (nuo 1993 m.), Glenne centru (nuo 1999 m.), Norvegijos Skien Rotary klubu (2004-2006 m.), Kauno Rotary klubu „Tauras“ (2007 m.). Pasirašytos bendradarbiavimo sutartys su Lietuvos aukštosiomis mokyklomis (VDU, LSMU, KK, LSU), bendrojo lavinimo mokyklomis (Garliavos Jonučių progimnazija, Alyvaus „Vilties“ mokykla-darželiu) ir kt.
2015 m. kovo 5 dieną Kauno miesto savivaldybės sprendimu pradėta rengti Kauno vaikų abilitacijos centro reorganizacija – centro sujungimas su Kauno Prano Daunio aklųjų ir silpnaregių ugdymo centru.